Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fen1P39749 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fen1P39749 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fen1P39749 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fen1P39749 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fen1P39749 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fen1P39749 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fen1P39749 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fen1P39749 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fen1P39749 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fen1P39749 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms