Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sar1aP36536 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sar1aP36536 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 219.8 ms