Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc5P35689 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms