Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ddit3P35639 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddit3P35639 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms