Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab23P35288 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab23P35288 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rab23P35288 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab23P35288 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab23P35288 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab23P35288 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab23P35288 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms