Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rab5cP35278 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rab5cP35278 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5cP35278 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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