Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp12P34960 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms