Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdh15P33146 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms