Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SsbP32067 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SsbP32067 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SsbP32067 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SsbP32067 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SsbP32067 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SsbP32067 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SsbP32067 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SsbP32067 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SsbP32067 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SsbP32067 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SsbP32067 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SsbP32067 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SsbP32067 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SsbP32067 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SsbP32067 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SsbP32067 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SsbP32067 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SsbP32067 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SsbP32067 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SsbP32067 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SsbP32067 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SsbP32067 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SsbP32067 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SsbP32067 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SsbP32067 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SsbP32067 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SsbP32067 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SsbP32067 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SsbP32067 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SsbP32067 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SsbP32067 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SsbP32067 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SsbP32067 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SsbP32067 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SsbP32067 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SsbP32067 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SsbP32067 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SsbP32067 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SsbP32067 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SsbP32067 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SsbP32067 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SsbP32067 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SsbP32067 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SsbP32067 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SsbP32067 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SsbP32067 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SsbP32067 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SsbP32067 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SsbP32067 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SsbP32067 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SsbP32067 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SsbP32067 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SsbP32067 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SsbP32067 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SsbP32067 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SsbP32067 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SsbP32067 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SsbP32067 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SsbP32067 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SsbP32067 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SsbP32067 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SsbP32067 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SsbP32067 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SsbP32067 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SsbP32067 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SsbP32067 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SsbP32067 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SsbP32067 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SsbP32067 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SsbP32067 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SsbP32067 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SsbP32067 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SsbP32067 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SsbP32067 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SsbP32067 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SsbP32067 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SsbP32067 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SsbP32067 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SsbP32067 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SsbP32067 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SsbP32067 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SsbP32067 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SsbP32067 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SsbP32067 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SsbP32067 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SsbP32067 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SsbP32067 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SsbP32067 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SsbP32067 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SsbP32067 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SsbP32067 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SsbP32067 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SsbP32067 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SsbP32067 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SsbP32067 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SsbP32067 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SsbP32067 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SsbP32067 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SsbP32067 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms