Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

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Length 1,964 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Notch4P31695 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Notch4P31695 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Notch4P31695 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch4P31695 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch4P31695 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch4P31695 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch4P31695 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch4P31695 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch4P31695 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch4P31695 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch4P31695 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Notch4P31695 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms