Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc10P31257 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc10P31257 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms