Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxa2P31245 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms