Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp2P29594 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp2P29594 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp2P29594 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp2P29594 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp2P29594 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp2P29594 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms