Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Defa5P28312 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Defa5P28312 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Defa5P28312 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Defa5P28312 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Defa5P28312 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Defa5P28312 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Defa5P28312 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms