Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa3P28310 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa3P28310 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa3P28310 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms