Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja4P28235 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja4P28235 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja4P28235 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja4P28235 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja4P28235 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja4P28235 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja4P28235 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja4P28235 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms