Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb1P28230 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms