Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav1P27870 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav1P27870 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav1P27870 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav1P27870 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav1P27870 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav1P27870 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vav1P27870 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vav1P27870 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vav1P27870 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms