Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CftrP26361 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CftrP26361 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CftrP26361 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CftrP26361 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CftrP26361 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CftrP26361 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CftrP26361 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CftrP26361 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CftrP26361 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CftrP26361 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CftrP26361 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CftrP26361 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CftrP26361 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CftrP26361 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CftrP26361 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CftrP26361 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CftrP26361 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CftrP26361 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CftrP26361 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CftrP26361 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CftrP26361 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CftrP26361 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CftrP26361 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CftrP26361 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CftrP26361 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CftrP26361 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CftrP26361 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CftrP26361 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CftrP26361 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CftrP26361 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CftrP26361 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CftrP26361 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CftrP26361 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CftrP26361 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CftrP26361 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CftrP26361 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CftrP26361 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CftrP26361 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CftrP26361 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CftrP26361 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CftrP26361 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CftrP26361 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CftrP26361 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CftrP26361 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CftrP26361 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CftrP26361 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CftrP26361 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CftrP26361 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CftrP26361 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CftrP26361 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CftrP26361 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CftrP26361 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CftrP26361 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CftrP26361 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CftrP26361 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CftrP26361 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CftrP26361 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CftrP26361 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CftrP26361 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CftrP26361 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CftrP26361 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CftrP26361 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CftrP26361 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CftrP26361 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CftrP26361 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CftrP26361 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CftrP26361 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CftrP26361 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CftrP26361 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CftrP26361 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CftrP26361 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CftrP26361 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CftrP26361 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CftrP26361 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CftrP26361 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CftrP26361 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CftrP26361 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CftrP26361 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CftrP26361 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CftrP26361 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CftrP26361 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CftrP26361 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CftrP26361 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CftrP26361 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CftrP26361 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CftrP26361 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CftrP26361 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CftrP26361 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CftrP26361 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CftrP26361 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CftrP26361 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CftrP26361 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CftrP26361 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CftrP26361 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CftrP26361 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CftrP26361 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CftrP26361 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CftrP26361 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CftrP26361 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms