Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms