Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccnd1P25322 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms