Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Aldh1a1P24549 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a1P24549 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a1P24549 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a1P24549 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a1P24549 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a1P24549 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a1P24549 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a1P24549 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a1P24549 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a1P24549 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a1P24549 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a1P24549 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a1P24549 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a1P24549 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a1P24549 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a1P24549 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a1P24549 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a1P24549 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a1P24549 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a1P24549 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a1P24549 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a1P24549 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh1a1P24549 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh1a1P24549 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh1a1P24549 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh1a1P24549 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh1a1P24549 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh1a1P24549 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh1a1P24549 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh1a1P24549 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh1a1P24549 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh1a1P24549 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms