Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd247P24161 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd247P24161 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd247P24161 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms