Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr3aP23979 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms