Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms