Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja1P23242 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja1P23242 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja1P23242 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja1P23242 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja1P23242 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja1P23242 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja1P23242 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja1P23242 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja1P23242 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms