Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk1P22518 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk1P22518 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk1P22518 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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