Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tap1P21958 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tap1P21958 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tap1P21958 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tap1P21958 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tap1P21958 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tap1P21958 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms