Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BdnfP21237 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BdnfP21237 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BdnfP21237 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BdnfP21237 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BdnfP21237 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BdnfP21237 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BdnfP21237 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BdnfP21237 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BdnfP21237 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BdnfP21237 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BdnfP21237 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BdnfP21237 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BdnfP21237 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BdnfP21237 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BdnfP21237 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BdnfP21237 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BdnfP21237 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BdnfP21237 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BdnfP21237 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BdnfP21237 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BdnfP21237 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BdnfP21237 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BdnfP21237 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BdnfP21237 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BdnfP21237 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BdnfP21237 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BdnfP21237 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BdnfP21237 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BdnfP21237 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BdnfP21237 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms