Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnc2P20801 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms