Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Prim1P20664 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prim1P20664 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prim1P20664 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prim1P20664 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prim1P20664 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prim1P20664 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prim1P20664 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prim1P20664 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms