Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TP20293 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TP20293 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TP20293 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TP20293 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TP20293 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TP20293 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TP20293 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TP20293 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TP20293 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TP20293 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TP20293 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TP20293 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TP20293 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TP20293 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TP20293 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TP20293 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TP20293 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TP20293 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TP20293 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TP20293 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TP20293 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TP20293 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TP20293 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TP20293 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TP20293 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TP20293 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TP20293 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TP20293 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TP20293 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TP20293 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TP20293 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TP20293 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TP20293 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TP20293 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TP20293 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TP20293 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TP20293 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TP20293 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TP20293 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TP20293 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TP20293 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TP20293 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TP20293 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TP20293 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TP20293 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TP20293 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TP20293 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TP20293 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TP20293 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TP20293 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TP20293 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TP20293 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TP20293 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TP20293 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TP20293 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TP20293 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TP20293 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TP20293 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TP20293 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TP20293 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TP20293 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TP20293 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TP20293 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TP20293 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TP20293 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TP20293 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TP20293 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TP20293 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TP20293 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TP20293 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TP20293 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TP20293 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TP20293 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TP20293 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TP20293 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TP20293 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TP20293 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TP20293 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TP20293 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TP20293 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TP20293 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TP20293 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TP20293 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TP20293 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TP20293 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TP20293 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TP20293 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TP20293 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TP20293 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TP20293 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TP20293 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TP20293 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TP20293 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TP20293 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TP20293 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TP20293 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TP20293 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TP20293 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TP20293 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms