Protein–RNA interactions for Protein: P19785

Esr1, Estrogen receptor, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esr1P19785 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Esr1P19785 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Esr1P19785 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Esr1P19785 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms