Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NefhP19246 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NefhP19246 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NefhP19246 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NefhP19246 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NefhP19246 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NefhP19246 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NefhP19246 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NefhP19246 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NefhP19246 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NefhP19246 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NefhP19246 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NefhP19246 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NefhP19246 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NefhP19246 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NefhP19246 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NefhP19246 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NefhP19246 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NefhP19246 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NefhP19246 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NefhP19246 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NefhP19246 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NefhP19246 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NefhP19246 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NefhP19246 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NefhP19246 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NefhP19246 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NefhP19246 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NefhP19246 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NefhP19246 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NefhP19246 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NefhP19246 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NefhP19246 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NefhP19246 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NefhP19246 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NefhP19246 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NefhP19246 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NefhP19246 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NefhP19246 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NefhP19246 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NefhP19246 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NefhP19246 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NefhP19246 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NefhP19246 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NefhP19246 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NefhP19246 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NefhP19246 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NefhP19246 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NefhP19246 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NefhP19246 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NefhP19246 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NefhP19246 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NefhP19246 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NefhP19246 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NefhP19246 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NefhP19246 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NefhP19246 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NefhP19246 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NefhP19246 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NefhP19246 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NefhP19246 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NefhP19246 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NefhP19246 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NefhP19246 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NefhP19246 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NefhP19246 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NefhP19246 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NefhP19246 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NefhP19246 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NefhP19246 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NefhP19246 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NefhP19246 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NefhP19246 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NefhP19246 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NefhP19246 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NefhP19246 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NefhP19246 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NefhP19246 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NefhP19246 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NefhP19246 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NefhP19246 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NefhP19246 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NefhP19246 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NefhP19246 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NefhP19246 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NefhP19246 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NefhP19246 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NefhP19246 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NefhP19246 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NefhP19246 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NefhP19246 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NefhP19246 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NefhP19246 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NefhP19246 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NefhP19246 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NefhP19246 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NefhP19246 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NefhP19246 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NefhP19246 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NefhP19246 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms