Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18528 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18528 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18528 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18528 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18528 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18528 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18528 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18528 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18528 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18528 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18528 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18528 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18528 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18528 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18528 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18528 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18528 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18528 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18528 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18528 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18528 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18528 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18528 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18528 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18528 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18528 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18528 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18528 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18528 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18528 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18528 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18528 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18528 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P18528 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18528 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18528 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18528 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18528 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18528 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18528 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18528 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18528 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18528 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18528 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18528 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18528 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18528 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18528 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18528 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18528 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P18528 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18528 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P18528 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18528 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18528 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P18528 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18528 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18528 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18528 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18528 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18528 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18528 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18528 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18528 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18528 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18528 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18528 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P18528 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18528 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18528 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18528 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18528 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18528 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18528 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18528 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18528 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18528 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18528 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18528 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18528 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18528 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18528 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
P18528 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18528 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18528 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
P18528 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18528 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18528 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18528 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18528 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18528 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18528 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18528 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18528 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18528 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18528 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18528 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18528 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18528 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms