Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtsdP18242 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsdP18242 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsdP18242 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsdP18242 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsdP18242 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsdP18242 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsdP18242 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsdP18242 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsdP18242 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsdP18242 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsdP18242 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms