Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Hoxb1P17919 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Hoxb1P17919 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Hoxb1P17919 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxb1P17919 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
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