Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms