Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gabra6P16305 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gabra6P16305 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gabra6P16305 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gabra6P16305 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gabra6P16305 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gabra6P16305 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gabra6P16305 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gabra6P16305 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gabra6P16305 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gabra6P16305 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gabra6P16305 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gabra6P16305 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gabra6P16305 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gabra6P16305 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gabra6P16305 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gabra6P16305 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gabra6P16305 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gabra6P16305 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gabra6P16305 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gabra6P16305 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gabra6P16305 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gabra6P16305 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gabra6P16305 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gabra6P16305 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gabra6P16305 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gabra6P16305 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms