Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rag1P15919 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rag1P15919 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rag1P15919 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rag1P15919 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rag1P15919 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rag1P15919 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rag1P15919 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms