Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Defa1P11477 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa1P11477 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms