Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms