Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms