Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms