Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf1P09925 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf1P09925 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf1P09925 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf1P09925 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf1P09925 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Surf1P09925 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Surf1P09925 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Surf1P09925 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms