Protein–RNA interactions for Protein: P09174

Pde6g, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6gP09174 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms