Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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