Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms