Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxb7P09024 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms