Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

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Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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